SMRT dizileme, sentez yoluyla dizilemeye dayanır. DNA sıfır modu dalga kılavuzları (ZMWs) içinde sentezlendi - küçük iyi alt kısmında yer alan yakalama araçları ile kaplar da benzeri. Sekanslama, modifiye edilmemiş polimeraz (ZMW tabanına bağlı) ve çözelti içinde serbestçe akan floresan olarak etiketlenmiş nükleotidlerin kullanımı ile gerçekleştirilir. Kuyucuklar, yalnızca kuyunun dibinde meydana gelen flüoresan algılanacak şekilde inşa edilir. Floresan etiket, nükleotidden DNA sarmalına dahil edildikten sonra, değiştirilmemiş bir DNA bırakarak DNA ayrılır.iplik. SMRT teknoloji geliştiricisi Pacific Biosciences'a (PacBio) göre, bu metodoloji nükleotid modifikasyonlarının (sitozin metilasyonu gibi) saptanmasına izin veriyor. Bu, polimeraz kinetiğinin açıklamasıyla olur. Bu, ortalama 5 kilobazlık okuma uzunlukları ile 20.000 nükleotit veya daha fazla analiz yapılmasına olanak tanır. 2015 yılında Pacific Biosciences, PacBio RS II cihazındaki 150.000 ZMW'ye kıyasla 1 milyon ZMW'ye sahip Sequel System adlı yeni bir sıralama cihazının piyasaya sürüldüğünü duyurdu. SMRT dizileme, "üçüncü nesil" veya "uzun okunan" sıralama olarak adlandırılır.
Resim 151A | Birden çok, parçalı birleştirme analizleri, örtüşen alanlarına göre bir araya getirilmelidir. | Suspencewl / CC0 | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Mapping_Reads.png) Wikimedia Commons'tan
Yazar : Milos Pawlowski
Yorumlar
Yorum Gönder