(Otomatik) ribozomal intergenik boşluk incelemesi (ARISA)

(Otomatik) ribozomal intergenik aralayıcı inceleme veya (A) RISA (Şekil 3), prokaryotik DNA 'nin iki yüksek düzeyde korunmuş geni, 16SrRNA geni ve 23SrRNA genini kodladığı gerçeğinden yararlanır. Bunlar, rRNA operonundaki küçük ve büyük alt birim genleri kodlar. Bu iki gen arasında, dahili bir transkribe edilmiş boşluk (ITS) bölgesi vardır. Proteinleri kodlamaması nedeniyle, oldukça değişken bir nükleotid birleşimi ve uzunluğu. Bir kez DNA bir eden izole edilir, PCR Bu aralayıcı bölgesini güçlendirir. Parçalar, bir jel (RISA) üzerinde çalıştırılabilir veya flüoresan primerler, bir elektroferogram (ARISA) üzerinde benzer olmayan parça uzunluklarının bolluğundaki piklere dönüştürülebilir.

Veri çıkışı ve yorumlama

Değişken kodlamayan bölgeler nedeniyle, RISA çıktısı, benzer olmayan bant desenlerine sahip bir jeldir ve ARISA için çıktı, benzer olmayan zirvelere (T-RFLP'ye benzer) sahip bir elektroferogramdır.

Resim 141A | Şekil 2. Denatüre Gradient Jel Electrophoresis olarak adlandırılan mikrobiyal parmak izi tekniği. Diyagram, benzer olmayan mikrobiyal topluluklardan alınan örneklerin nasıl karşılaştırılabileceğini göstermektedir. | Ilyanassa / CC BY-SA (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://en.wikipedia.org/wiki/File:Step-by-step_procedure_of_using_DGGE_analysis_in_microbiology.pdf) Wikimedia Commons'tan

Resim 141A | Şekil 2. Denatüre Gradient Jel Electrophoresis olarak adlandırılan mikrobiyal parmak izi tekniği. Diyagram, benzer olmayan mikrobiyal topluluklardan alınan örneklerin nasıl karşılaştırılabileceğini göstermektedir. | Ilyanassa / CC BY-SA (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://en.wikipedia.org/wiki/File:Step-by-step_procedure_of_using_DGGE_analysis_in_microbiology.pdf) Wikimedia Commons'tan

Yazar : Milos Pawlowski

Referanslar:

Moleküler Biyoloji Teknikleri I

Moleküler Biyoloji Araçları II

Yorumlar