Büyük ölçüde paralel imza sıralaması (MPSS)

Yüksek verimli sıralama teknolojilerinin ilki, büyük ölçüde paralel imza dizileme (veya MPSS), 1990'larda Sydney Brenner ve Sam Eletr tarafından 1992'de kurulan Lynx Therapeutics'te geliştirildi. MPSS, adaptör ligasyonunda bir complex kullanan, ardından adaptör kod çözme, birleştirmeyi dört nükleotidlik artışlarla okuyan boncuk tabanlı bir complex işlemdi. Bu işlem, diziye özgü önyargıya veya belirli dizilerin kaybına açık hale getirdi. Teknolojinin böyle olduğu gerekçesiyle complex, MPSS yalnızca Lynx Therapeutics tarafından "şirket içinde" yapıldı ve DNA sıralama makineleri bağımsız laboratuvarlara satıldı. Lynx Therapeutics, 2004 yılında Solexa ile birleşti (daha sonra Illumina tarafından satın alındı) ve sentez yoluyla sekanslamanın geliştirilmesine yol açtı, Manteia Predictive Medicine'den elde edilen ve MPSS'yi modası geçmiş hale getiren daha basit bir ürün. Her neyse, MPSS çıktısının temel özellikleri, yüzbinlerce kısa DNA dizisi dahil olmak üzere daha sonraki yüksek verimli veri türleri için DNA tipikti. MPSS durumunda, bunlar genellikle ifade seviyelerinin gen formunun ölçümleri için cDNA'nın sıralanması için kullanılmıştır.

Resim 151A | Birden çok, parçalı birleştirme analizleri, örtüşen alanlarına göre bir araya getirilmelidir. | Suspencewl / CC0 | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Mapping_Reads.png) Wikimedia Commons'tan

Resim 151A | Birden çok, parçalı birleştirme analizleri, örtüşen alanlarına göre bir araya getirilmelidir. | Suspencewl / CC0 | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Mapping_Reads.png) Wikimedia Commons'tan

Yazar : Milos Pawlowski

Referanslar:

Moleküler Biyoloji Teknikleri I

Moleküler Biyoloji Araçları II

Yorumlar