Büyük ölçekli sıralama ve de novo sıralama

Çok uzun sekanslanması sık sık amaçları büyük ölçekli dizileme DNA adet bulunan ile gösterildiği gibi bir şekilde, kısa sekansların çok büyük sayılar üretmek için kullanılabilir gibi büyük ölçekli dizileme kutu rağmen bütün kromozomlar ile gösterilen phage display. Kromozomlarla gösterildiği gibi daha uzun hedefler için yaygın yaklaşımlar, büyük DNA fragmanların daha kısa DNA fragmanlara kesilmesi (sınırlayıcı enzimlerle) veya kesilmesinden (mekanik kuvvetlerle) DNA oluşur. Parçalanmış DNA daha sonra bir DNA vektörüne klonlanabilir ve Escherichia coli ile gösterildiği gibi

bakteriyel bir konakçıda amplifiye edilebilir. Kısa DNA Bireysel bakteri kolonilerinden saflaştırılan fragmanlar gösterge niteliğinde sekanslanır ve elektronik olarak tek bir uzun, bitişik birleştirme halinde birleştirilir. Çalışmalar, tek tip boyuttaki DNA fragmanlarını toplamak için bir boyut seçme adımı eklemenin, dizileme etkinliğini ve genom montajının doğruluğunu artırabileceğini göstermiştir. Bu çalışmalarda, otomatik boyutlandırmanın manuel jel boyutlandırmaya göre daha tekrarlanabilir ve hassas olduğu kanıtlanmıştır.

Resim 149A | Otomatik zincir sonlandırma DNA sıralamasının sonuçlarına bir örnek. | Abizar at İngilizce Wikipedia / CC BY-SA (http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Radioactive_Fluorescent_Seq.jpg) Wikimedia Commons'tan

Yazar : Milos Pawlowski

Referanslar:

Moleküler Biyoloji Teknikleri I

Moleküler Biyoloji Araçları II