DNA Belirli bir proteine bağlanan DNA sekansları, o proteinin (ChIP) immünopresipitasyonu yoluyla izole edilebilir, bu fragmanlar daha sonra bir microarray 'ye (bir döşeme dizisi gibi) hibridize edilerek genom boyunca protein bağlanma sahası doluluğunun belirlenmesine izin verir. histone İmmün çökeltiye örnek protein, histone epigenetik manzarayı incelemek için histone modifikasyonları (H3K27me3, H3K4me2, H3K9me3, vb.), Polycomb grubu proteini (PRC2: Suz12, PRC1: YY1) ve tritoraks grubu proteini (Ash1) veya RNA Polimeraz II, kopyalama ortamını incelemek için.
DamID
ChIP'ye benzer şekilde, ilgi konusu bir protein tarafından bağlanan genomik bölgeler izole edilebilir ve bağlanma yeri doluluğunu belirlemek için bir microarray ' yi araştırmak için kullanılabilir. DamID ChIP'den farklı olarak, DamID, antikor gerektirmez, ancak proteinin bağlanma bölgelerinin yakınında adenin metilasyonunu kullanarak bu bölgeleri seçici olarak DNA büyütür ve bakteriyel DNA adenin metiltransferaza bağlı çok az miktarda ilgili proteini ifade ederek DNA sokulur.
Resim 146A | İki Affymetrix çipi. Boyut karşılaştırması için sol altta bir eşleşme gösterilir. | Makine tarafından okunabilen yazar sağlanmadı. Schutz varsaydı (telif hakkı iddialarına dayanarak). / CC BY-SA (http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Affymetrix-microarray.jpg) Wikimedia Commons'tan
Yazar : Milos Pawlowski
Yorumlar
Yorum Gönder